Die Geschäftsstelle koordiniert die Arbeit der Wirtschaftsallianz Bottrop, der Strategischen Allianzen und der Reallabore. Alle Governance-Prozesse werden organisiert, begleitet und dokumentiert. Außerdem ist sie der erste Ansprechpartner für alle Mitglieder.

Die Geschäftsstelle ist Teil des Amtes für Wirtschaftsförderung und Standortmanagement und besteht aus Fabian Knappik.